ちなみに、vagrant statusやvagrant sshは普通に使えました。
$ vagrant halt
An action 'halt' was attempted on the machine 'default',
but another process is already executing an action on the machine.
Vagrant locks each machine for access by only one process at a time.
Please wait until the other Vagrant process finishes modifying this
machine, then try again.
If you believe this message is in error, please check the process
listing for any "ruby" or "vagrant" processes and kill them. Then
try again.
原因はホストマシン側(自分の場合はWindows)で動いているrubyによるものらしい。
vagrantコマンドを実行するとホストマシン上でrubyが実行されるのですが、
コマンドの処理終了のタイミングでrubyのプロセスも切れる様になっている。
しかし、このメッセージが出ている時は、rubyのプロセスが切れずに残り続けている状態になっていた。
対応としては、該当のrubyのプロセスを切ってやればいい。
タスクマネージャーを開くと、ruby.exeというプロセスが残っているはずなので、それを右クリックしてプロセス終了をクリック。
終了したら通常通りvagrant haltやsuspendなどが使えるようになりました。